如果北航能够有最好的专业可以选，当然是选择去北航。
南京大学作为综合性的比较靠前的院校，名气，影响力来说肯定是比北航会更大一些。
但是综合性的大学并不是所有的专业都能够很好的适应社会的需要。北航的很多理工科专业，那都是国家社会非常需要的人才，出来职场也很容易找到工作。
建议你选择北航，有句话说的好，宁当鸡头，不当凤尾，你要知道卡分进去就异味你要调剂专业，将来你要上的是一个冷门专业，是这个学校不好的专业，不会被录取到你想选的专业的，这是可以肯定的。
你去北航你可以上他们的王牌专业，这个毋庸置疑，就相当于是你在选择学校而不是学校在选择你了，这两学校分数也相差不多，既然是最好的专业这就证明以后不会差。
作为一个过来人来说，我觉得宁可去南京大学。因为一所综合实力很强的学校（北航也很厉害，但是偏理工科），它给你带来的资源是其他学校不能对比的！你的社交，你的视野，你的综合能力提高都与你这所学校息息相关。其次，就算你在南大一开始不能选择一个好的专业，但是你要记住这个选专业并不像高考是一考定终生的，你还是有许多改变的机会！比如：在大一的学习后，在你对你的大学你的专业有一定了解后，你知道你自己喜欢什么，想做什么，这时候大一大二是有一次转专业的机会的（不过一般需要成绩名列前茅）。除此以外，你保研或者考研也是有机会换专业换学校（南大这种学校保研率很高的哟）。就算考研，南大的学生发挥再失常，还是有许多学校要你。人生什么最重要？方向最重要！
如果学校层次相差甚远，当然是首选学校。如果相差不多，当然首选专业。如果让我选择肯定是去北航最好的专业。可以参照一下华东师范大学版的大学录取分数排行榜，这个排行榜是根据各高校在各省的录取分数，用映射算法测算出来的，对报考大学参考价值极大。从排名可以看出理科录取分数排名南大第9，北航第10，差别很小，也就是说两个学校没有质的差别。因此，进南大去最差的专业而不去北航最好的专业太亏，可以说是亏大了。北航和南大的名气都挺大的，在人们的认识中，都是不错的学校。卡分进南大，理想的好专业我估计很难上吧？相比之下，北航的最优秀专业就是首选，这没什么可犹豫的。南京大学和北航都是985高校，虽然南大是C7排名更前面，但北航地域在北京有地域优势，在层次上两校差距并不大，保研率方面也相差不多，个人认为在层次差不太多的院校间，应兼顾专业的选择，选个心仪专业对下一步学习深造，以及将来就业将更有帮助。因此，卡线进南大，势必只能去冷门专业，很可能这些专业就是自己不能接受的，不如退一步去北航学一个心仪的优势专业。当然，如果你本就心仪南京大学的冷门专业，就可考虑卡线去南大了。
选学校还是选专业，这个要看情况而定，而且这里面有运气成分，或者说未知因素太多。
选学校的都是因为好的学校带给你的视野、人脉、素质提升等都是不一样的，而这些都是很重要的考量指标。
选专业的都是因为直奔就业去的。现在工作不好找，就业压力很大，导致同样一个学校毕业的学生，境遇不同。如果选了一个不好就业的专业，势必会和同龄人拉开差距。但这就有不确定因素了，热门专业也许过几年变冷门，冷门专业也有一些特定的单位需要。一个人的专业也是可以通过考研等方式改变的。再加上现在好多都是专业不对口的。
既然专业的不确定性大，还不如选学校，至少综合考虑，好学校带给人更多可能性。
南京大学，教育部直属，中央直管的副部级高校，985，211，双一流高校。南京大学位于南京市，是一所有百年历史的名校，历史辉煌，学校师资力量雄厚，学风优良，教学底蕴深厚，学科门类齐全，在文、理、工、管学科上均非常优秀，在国内综合性大学排名靠前。其理科学科天文学、地质学被评为A+，物理学、生物学被评为A，数学、化学、生态学、地理学被评为A-，在国内高校理科综合实力排名第三，仅次于北大与中科大。其中A类学科21个，A+学科3个。
北京航空航天大学，简称北航，工信部直属，中央直管副部级高校，985，211，双一流高校。北航位于北京市，于1952年成立，是新中国第一所航空航天高等学府。北航现已形成了航空航天与信息技术两大优势学科群，在航空、航天、动力、信息、材料、仪器、管理等学科领域有明显的优势，学校现有14个A类学科，其中航空宇航科学与技术、仪器科学与技术、材料科学与工程、软件工程被评为A+。
南京大学与北航都是我国高校里排名前十的顶级大学。南京大学文理学科强，工科实力跟北航比起来实力较弱，在全国高校各省份录取分数线平均排名第8，今年在河南省一本理科投档线为689分。北航是以工科为主的高校，工科实力能排进全国高校前五，在全国高校各省份录取分数线平均排名第9，今年在河南省一本理科投档线为684分。两所高校录取分数线近几年相差不是太大，南京大学是华东五校之一，名气更大一些。如果同时选择计算机这样的热门专业，两所高校的计算机科学与技术学科均为A，但南京大学的录取分数线更高，而北航的工科氛围更好，学习起来效果更好，性价比非常明显。
南京大学与北航是两种不同类型的高校，各有各的优势。现在的工科高校更受考生与家长的青睐，热门工科专业的就业率高，就业形势好。同样的分数建议专业优先，选择北航。
选择北航。
两者对比选择，选择性价比最高的北航。
(1)地域上，北京远胜南京。在哪个城市上大学，基本上可以决定了对你的未来四年视野的塑造。
(2)专业上，北航可以选最好的专业，性价比大于南京大学的将就专业。
(3)两者在理科生排名差距不大，北航亦以理工见长！
总而言之，北航性价比更高！
1.选专业，北航强势专业不输南大，2压分南大也进不了北航最优专业，我儿子就是这种情况。
肯定选北航，这两个学校的层次差不多，北京地域更有优势，北航最好的专业肯定比南大的冷门专业将来发展的前景要好
能上北航还稀罕南京大学吗？
大家好，我是小橙同学。看到你这个问题，我相信很多网友都会很诧异，甚至无厘头喷：北航和南大能是一个分数线吗，南大不应该比北航高很多吗？
事实并不其然，这其实跟地域有很大的关系。像在我们江苏，因为江苏人很少愿意出省，像我当年高考成绩如果出省的话能上好多985高校，但是在省内南大上不了，东南选择不了好的专业，去南航专业又能够随便挑。
作为一个过来人来说，我觉得宁可去南京大学。因为一所综合实力很强的学校（北航也很厉害，但是偏理工科），它给你带来的资源是其他学校不能对比的！你的社交，你的视野，你的综合能力提高都与你这所学校息息相关。
其次，就算你在南大一开始不能选择一个好的专业，但是你要记住这个选专业并不像高考是一考定终生的，你还是有许多改变的机会！比如：在大一的学习后，在你对你的大学你的专业有一定了解后，你知道你自己喜欢什么，想做什么，这时候大一大二是有一次转专业的机会的（不过一般需要成绩名列前茅）。除此以外，你保研或者考研也是有机会换专业换学校（南大这种学校保研率很高的哟）。就算你考研，你南大的学生发挥再失常，还是有许多学校跪舔。
南大确实名气大。但是这个档次，专业太重要了。南大毕竟不是清华北大或者复旦
北航。两个学校差没太多，计算机、电子等专业北航更强。
肯定北航
当然北航，
在这个层次上，我肯定选北航。我个人在北京和南京两个城市中，喜欢北京，还可以选择喜欢的专业。
先来个比喻：选择大学就相当于选择体育场，选择专业则相当于选择跑道。
体育场不好，还可以通过努力重新选择。而跑道一旦选错，有多大的本事都是徒劳。
南京大学是比北京航空航天大学好，但是卡分数进入南京大学的差专业，还不如进入北航的优势专业。如果不喜欢北航，四年后还可以通过考研进入南京大学、甚至清华大学。
重点中学的孩子可以考985、普通中学的孩子也可以考985。同样的道理，南京大学的毕业生跟北航的本科毕业生考清华研究生起跑线是一样的。
人生什么最重要？方向最重要！
南大
个人觉得应该具体分析。
如果你是文科生，或者选课侧重文科，个人推荐选择南京大学。
文科，学校的实力，地域更重要。南京大学的汉语言文学与北航的汉语言在本科阶段差距不大。
现在本科阶段已经不能满足就业要求，多数要考研究生，名校在考研方面具备着独特的优势。
当然，也有特殊情况，有人就是喜欢北京，所以选择北航也是可以的。选择自己喜欢的也是没有问题的。
如果是理科生，我推荐选择北航。首先理科的专业垂直度与学校有密切关系。这时，专业实力强劲的学校就是一个比较好的选择。
其次，北航的工科专业，和国防密切的专业实力是很强的。相对来说，南京大学在这方面比较弱。所以喜欢工科专业的，北航更好些。
所以，理科选择优先考虑专业。
针对以上问题，要根据具体情况，合理的理性的选择。
南京大学和北航都是985高校，虽然南大是C7排名更前面，但北航地域在北京有地域优势，在层次上两校差距并不大，保研率方面也相差不多，个人认为在层次差不太多的院校间，应兼顾专业的选择，选个心仪专业对下一步学习深造，以及将来就业将更有帮助。
因此，卡线进南大，势必只能去冷门专业，很可能这些专业就是自己不能接受的，不如退一步去北航学一个心仪的优势专业。当然，如果你本就心仪南京大学的冷门专业，就可考虑卡线去南大了。