一、南北少林的区别有：
1、创始人不一样：北少林传说源于达摩祖师，是中国禅宗的祖庭，少林武学的发源地。关于南少林，相传河南嵩山少林寺13武僧帮助唐太宗统一中国后，唐太宗赐于僧兵，并准许在全国各地建立十座分寺。
2、创立的时间不一样：北少林始建于魏晋，至今已有1500年左右的历史，是蓟县县志记载的当地最早的佛教寺院，也是天津最早的寺院。南少林建于南朝初年(公元577年)，是南少林武术文化的发源地。
3、争议不一样：少林寺一般指的是河南登封嵩山少林寺，也就是北少林。大量的资料显示南少林的确存在过，但却在清朝时因参与反清复明活动被清廷镇压了，是彻底焚毁还是改名换姓，至今尚被研究者争论。
南拳北腿均是少林功夫，南北少林本为一家。
中国地域广，地大物博！人口多，需要练武的人也多，难免有些照应不到，所以也就会出现南北少林寺多这个现象！
南少林莆田，北少林登封。据悉，很早以前一北少林寺武僧云游福建，看中了这块风水宝地，自创南少林。也可能其中另有隐情？
人有男女，地分南北。
一个在福建，一个在河南，是地域位置区分吧，不管那个少林，都是我们国内的文化
少林寺的由来
少林寺位于河南登封县城西北15公里的少室山北麓五乳峰下，建于北魏太和十九年（495年）。孝昌三年（公元527年）印度僧人菩提达摩在此首创禅宗。禅宗历史上称达摩为初祖，称少林寺为祖庭。唐初，少林寺和尚佐唐王开国有功，从此僧徒常习拳术，少林拳负有盛名，广为流传。
寺内现存建筑有山门、客堂、达摩亭、白衣殿、地藏殿和千佛殿（又名毗卢殿）等。千佛殿内有著名的明代五百罗汉朝毗卢壁书，展长约300多平方米；白衣殿内有清代少林寺拳谱、十三和，尚救唐王（李世民）壁画。达摩亭相传是二祖慧可在门外立候达摩、大雪没膝却纹丝不动的地方，故又叫立雪亭。寺西的塔林，西北的初祖庵，以及附近的唐代法如塔、同光塔，五代时的法华塔，元代的缘公塔等，在建筑史上都有重要地位.
据泉州少林寺释常定监院介绍，泉州少林寺，亦称南少林寺，原名“镇国东禅少林寺”。据清代晋江某学者撰于嘉庆年间的“西山杂志”载，相传为唐初嵩山少林寺武僧十三空之智空入闽所建。
中国素有“天下功夫出少林”之誉。而少林之中，又分南北，世传“天下少林有二，一在中州，一在闽中。”南北少林同源一宗。北以嵩山少林为正宗，南以泉州少林为代表，南北少林，相互辉映，齐誉于天下。
泉州少林寺，建于唐，址在清源山之东岳山麓，素为我国南禅及南少林武术之中心，声名远播，影响深广。自唐、宋、元、明、清、民国至今，一千多年来的文献文物以及史料，凿凿可证。
1、创始人不一样：北少林传说源于达摩祖师，是中国禅宗的祖庭，少林武学的发源地。关于南少林，相传河南嵩山少林寺13武僧帮助唐太宗统一中国后，唐太宗赐于僧兵，并准许在全国各地建立十座分寺。
2、创立的时间不一样：北少林始建于魏晋，至今已有1500年左右的历史，是蓟县县志记载的当地最早的佛教寺院，也是天津最早的寺院。南少林建于南朝初年(公元577年)，是南少林武术文化的发源地。
3、争议不一样：少林寺一般指的是河南登封嵩山少林寺，也就是北少林。大量的资料显示南少林的确存在过，但却在清朝时因参与反清复明活动被清廷镇压了，是彻底焚毁还是改名换姓，至今尚被研究者争论。
4、“天下功夫出少林”，以“南拳北腿”著称的南北两座少林寺院的僧人，匡扶正义，历次救国家于危难之中。然而，少林寺难逃被焚烧的命运。一千多年过去了，当年赫赫声名的南北两少林寺，只留下北少林依然屹立在嵩山之上，香火旺盛，南少林寺此刻却销声匿迹了。为此，人们开始了历史的追踪。
5、拳法不一样。作为中华武术一大流派的南少林拳，其起源可追溯到800多年前，流行我国长江以南的闽、粤、桂、赣、浙、湘、鄂、川、苏等省，其内容十分丰富，各地流传的南少林拳自成体系，各具风格，素以阳刚之美著称的南少林拳以沉稳、刚猛、迅疾、奇巧及落地生根般的扎马而著称。它发源于闽中，流传于闽台、两广、湘、赣、江浙、港澳及东南亚、日本等地，有极为广泛而深厚的群众基础，并已发展衍变出许多风格各异的流派。其中以动物为象形的各种拳法如南少林龙、虎、豹、蛇、鹤五形拳，还有五祖拳、罗汉拳、梅花桩、踪鹤拳、地术拳法、泳家法、五枚拳、狮拳、猴拳、鱼法、鸡法、儒法、仿鸟迹等流派。还有以八步连、四门斗底、七步行、阴阳手、水火手、夹套、基手等套路和不以套路为重的民间散打和以各种农具、用具（如锄头、扁担、簸箕、板登等）为器械的技艺，也颇具特色。
北拳主要是河北沧州一带拳法，北方人身高马大。
南北少林是同时期发生的，以禅宗为主，后因教义分化出渐悟(北）和顿悟(南），而因产生南北少林。