你好，我是武汉龙哥，很高兴来回答你的提问，首先在哪里工作都一样，只要不怕苦不怕累，能吃苦用自己的双手，勤劳致富，不管到哪里都能干出一番天地。
我觉得还是区直有更好的发展
事业单位的副科，如果正科很年轻，和你年龄差距不大，那你很难有在本科室转正科的机会，除非你得到单位大领导赏识，有机会通过换岗换部门的方式把你提拔为正科，或者你的正科刚好被调离，空出了你这个部门的正科岗位，同时你还是要得到单位大领导的认可，那么，在你的正科离开这个部门的时候，你有机会主持工作。一句话，就是要有大领导欣赏你，才能提拔你。
提拔考核正式任职是需要按照流程来走的。切记，提拔的关键是得到大领导欣赏并有合适的岗位机会，那么你就会进入候选人员名单就有机会被提拔。
从正科之后是副处、正处，需要综合衡量你的升职空间。一般而言，事业单位的正副处名额很少，如果你不是特别优秀，那么你的晋升空间不太大。
乡镇属于基层单位，很锻炼人的综合能力，在基层要出成绩，是要踏踏实实干出来的，如果你想真的做点事情，建议你到基层去，一是编制转为公务员，工资待遇可以按照公务员的正常年限加工资，二是基层机会多，多调研多写报告，上面大领导来调研工作的时候，你出色的汇报会让你很快脱颖而出，给领导留下深刻的印象。现在组织选拔任人才，很注重基层工作经历和经验。一份耕耘一份收获，是金子，在基层更容易发光。
从待遇收入而言，参公的事业单位和公务员系统差不多，二类事业单位比一般公务员可能会多一些；从升职机会而言，基层公务员有能力的会更容易有机会提拔，你作为副科待遇到基层，会更有优势。
综合考虑你自身的真实想法，想做点事情，就甩开膀子加油干到基层去，有公务员的待遇就应有公务员的担当。在事业单位发展就夯实专业技能，即便暂时不能被提拔，作为专业技术人员也总是有发挥的舞台，虽然这个舞台不一定是正职岗位。
以上建议供参考，希望你早日确定方向，发挥才智！
区直事业单位比较轻松，上下班方便，待遇也不错。如果走管理岗，进步比较慢，如果走技术岗，应该很快。乡镇公务员，比较辛苦，上班远，工作琐事多，像扶贫、防火等，基本白＋黑，五加二。但是公务员现在职级并行，长远看，还是公务员发展空间和福利待遇好。不过，事业单位职级并行，不久的将来也会实现。关于事业单位职级并行，你可以看一下我发的。所有的问题，都是具体问题具体分析。如果你家庭条件不错，家里没有什么负担，我建议你下乡转公务员；如果你家庭经济基础较差、父母又需要照顾，我建议你留在区直事业单位，走技术岗。
当然要去，转公务员身份是多少事业编梦寐以求的。
现在公务员和事业编之间还是有差距的，不论工资待遇还是发展前景，事业编在很多方面都比不上公务员。所以，有转公务员的机会一定要抓住，即便你不想到乡镇工作，你完全可以在转为公务员以后再往区里调动。
就你目前的情况来看，虽然已经提拔了事业编副科，但是想要再进一步升为正科，估计还是比较费劲的。因为随着事业单位的改革，很多事业单位已经在逐步合并或者取消，现在一个区里的正科级事业单位是少之又少，将来想要提拔为事业单位一把手，竞争还是比较大的。
而如果转为公务员以后，作为乡镇领导班子成员，提拔正科的机会还是很大的，即便提不了实职正科，你也可以通过职级并行升为二级主任科员、一级主任科员。将来再有机会还可以回区直机关任职，实在不能提拔任职，调到局机关当个科长、股长，也比在事业单位要好的多。
最重要的是，事业编转公务员的机会很少，有多少人都在挤破头想进入公务员队伍。事业编转公务员，日常情况下，只能是通过调任来解决，而你也正好符合调任条件，即便领导不提，你也要主动申请去。
总之，事业编转公务员不是你想转就能转的，既然有调任机会，就一定要抓住。
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在事业单位人员和公务员之间选择，肯定是公务员更好了，即使为了转公务员身份，承受一些损失，都是值得的。区直事业单位一般就是正科到头，值得留恋的有两点，一是工作和生活环境，二是如果能“双肩挑”，领职称工资，工资也很高。39岁才提的副科，在事业单位就是副职，管理八级，要说前途嘛，也很一般，毕竟过了35岁以后，就没有什么优势了。
事业单位提拔后，要两年以后才能转公务员岗位。原来，事业人员超过40岁就不能转公务员了，现在年龄放宽到了45岁，因而39岁提拔，转公务员的机会还是有。那么是转还是不转，要根据自己的实际情况，结合以下几点考虑选择：
1、工作和生活环境的影响：39岁年龄，正是孩子求学的关键时期，如果从区直转到乡镇任职，配偶如果工作忙，或者有什么事，孩子有没有人照顾，就是需要考虑的一个非常重要的因素。如果双方父母在身边，可以照顾得到，那么就可以考虑去乡镇，反正一个人吃饱，全家不饿，不用考虑家庭没有人照顾。
2、事业单位待遇的影响：如果在事业单位是“双肩挑”，职称晋升到了中级以后，就要慎重考虑，是不是有必要再转公务员。虽然同样受名额限制比较严重，但职称晋升相对公务员职级提升，更为容易一些。提升到了高级职称，待遇会涨一大截。当然，如果所在的事业单位发展前途比较好，福利待遇可观，也可以继续留下来。
3、拒绝组织提拔晋升的影响：如果组织任命去乡镇工作，个人如果因家庭、身体等方面的原因，可以明确拒绝。一般来讲，组织也会尊重个人意愿，不会过分为难。这也不是关键时期，算不上逃兵，你不去，想去的人多的是。也不用担心拒绝组织任命后，会被拉入黑名单。铁打的营盘，流水的组织，你刚提拔，等你下次面临提拔晋升的时候，组织部门的领导都换了一茬了，谁还会记得你曾经有这么一档子事。
39岁，城区事业单位副科，两年后有机会去乡镇转公务员，去不去？
我的意见是：去。
理由有三：
第一，去了可以转身份，工资待遇和职业空间都会大大拓展。在城区事业单位任副科，虽然是领导，可因为不是公务员，没有车补，也没有乡镇补贴，年终绩效也不如公务员，几项收入加起来，一年满打满算要少两三万块钱。而且，转了公务员提拔空间相对更大，进可提正科实职，回城区机关或继续在乡镇都可，退有职级并行，照样可以拿到正科甚至副处的待遇，这些你在事业单位都不可能享受到。最关键的是，你只有转了公务员副科，才有了当领导的味道，才能进入领导视线，干事创业的成就与你在事业单位截然不同。
第二，城区的乡镇不是县里的乡镇，名义叫乡镇，实际上是城郊，离家不会太远，条件也不会那么恶劣。去了即便回不到机关，无非多开二十分钟车而已，不用担心背井离乡，夫妻两地分居问题，本质上和在城里没什么区别。而因为是在城郊，类似的乡镇经济条件都不会太差，有钱好办事，从机关去乡镇某种程度上来说也是重用。小公这里的城区乡镇书记，基本上都是高配副处，要么进常委班子，要么进政府班子，那不是一般的牛，在这样的乡镇干活，前途都不会太差，至少有实惠。
第三，你才39岁，不是49岁，年龄不算小，其实也不大，在城区属于中坚力量，还有机会上升，趁着还有精力和心性，多拼点，多干点，看看自己能力有多大，成就有多高，不是坏事，以后也是你个人回忆的精彩篇章。人在有能力的时候过早的收缩，是对自己不负责。有机会去闯，不应该放过。