这个问题很难说，要看资历，如果资历浅的实职副科也有可能是四级主任科员的，那么晋升三级主任科员也需要公示，就工资而言同等的工龄比事业编的副科实职高。
你这个分析令人糊涂，两个不同性质的单位本来没有可比性，如果侃大山硬要来比较的话，我倒与你观点相反。题目给的排名是指什么排名不清楚，大概是指级别地位排名吧。事业单位副科级在本单位大小是个领导，如是县区级单位还是班子成员。而三级主任科员级别不一定比人家高，更主要还是一般普通职工而已，凭什么排名在领导之前呢？
谢邀！
一般情况下，当然应当是副科实职排名在前。
一、副科实职是领导职务
副科实职是副科级领导职务，虽然处于最低层次的领导职务，但毕竟也是领导职务，一般在正常情况下，应当是排名在前面的。
二、三级主任科员是职级
三级主任科员是职级，不是行政职务，也就是相当于职务职级并行前的非领导职务，行政级别相当于副科级，不在单位领导名单里，所以，一般也不进入领导排名。
《公务员职务职级并行规定》第七条职级序列按照综合管理类、专业技术类、行政执法类等公务员职位类别分别设置。
综合管理类公务员职级序列分为：一级巡视员、二级巡视员、一级调研员、二级调研员、三级调研员、四级调研员、一级主任科员、二级主任科员、三级主任科员、四级主任科员、一级科员、二级科员。
事业单位职务职级并行，也是同样的，三级主任科员是职级，并不是职务，当然也不是领导职务。
三、特殊情况下可能排名在前
特殊情况下，原副科实职改任三级主任科员，可能排名在后任副科实职之前，但必须是上级干部管理部门予以明确。
免责声明：图片来源于网络，如有侵权请联系删除。
三级主任科员是非领导系列，事业编副科实职是领导类公务员系列。后者应该排名靠前。
三级主任科员只是职级待遇，事业编实职副科是实职，又可能领导三级主任科员，如果两人在一个部门的话，当然实职副科靠前
体制内的排名考虑的因素比较多，纵向比较既要考虑职务因素，也要考虑职级因素；横向比较既要考虑同一部门，也要考虑单位性质。正常来讲，在不考虑太多因素的情况下，三级主任科员排名会在事业编副科实职前面。
主要是因为：
一方面，三级主任科员只会在行政机关产生，自然三级主任科员代表的是行政机关。通常来讲，行政机关都是事业单位的主管部门，领导事业单位，从讲政治的角度来讲，行政高于事业，因此即便是行政单位或上级主管部门的更低一级职务或职级人员，比如一级科员到事业单位开会，通行做法也会排到事业单位领导前面。比如，我们这里每年考核机关领导班子时，组织部的考察组中有的是一级科员，开会时照样排到了我们一些副处级领导干部前面，这是出于对上级的尊重。
另一方面，三级主任科员很多都是单位的实职副科晋级而来，而且兼任科室副科长，无论从地位、经历、政治的高度，还是出于尊重的考虑而言，毫无疑问，三级主任科员也是要排名放在事业单位实职副科前面的。即便三级主任科员不兼任实职副科，从行政领导事业的角度讲，依然是这样。
事业单位能够走到实职副科，也绝非一般人了，无论于情于理，党员干部都是讲政治的，在这个问题上大家都不迷糊。
若按照传统，事业实职副科排名肯定比没有职务的三级主任科员靠前，但现在公务员编待遇和发展前途与管理型事业编天壤之别，一个普通公务员也比一个事业副科各方面都牛逼
一般来说，三级主任科员排名靠前，主要有两个方面的原因：
一是身份不同。三级主任科员肯定是公务员身份，一般来说行政机关都是领导机关，事业单位作为辅助单位或者公益类服务单位，是处于被领导层面，一般行政机关排序在事业单位前面。
二是级别不同。三级主任科员虽然还是副科级干部，但是要比行政编的副科级高一点的等级，可以理解为大的副科，一般由副科实职或者四级主任科员晋升过来。所以这样来看，三级主任科员大于行政编副科实职，行政编副科实职一般排序在事业编副科实职前面，所以毫无以为，三级主任科员要排序在事业副科前面。
这里面其实也有特殊情况，就是看单位层次。比如市教育局的教育考试院副科长到县市区检查工作，县市区的教育局的三级主任科员陪同，这个时候排序就要好好斟酌了，毕竟是上级单位来检查，代表的不仅仅是个人，还是市直单位层面。
这个时候排序可能事业编副科在前面，三级主任科员在后面。
这是我的理解，请参考。
一个是职务，一个是职级，职级再高没有实职也不是领导，实职副科再小也是领导，比如本人一级主任科员，我们副局长是三级主任科员，副局长是实职，我是改非人员，难道还能把我一个高职级人员排到副局长之前，更何况职级人员不是领导班子成员，哪有资格和实职领导排序？就这么简单，你说谁排名在前？
三级主任科员和事业编副科实职，二者各有各的优势。至于排名，要区分具体情况、具体场合，三级主任科员未必一定排在事业编副科实职前面。我们以县直单位为例。
一、从编制性质上排序，三级主任科员排在事业编副科实职前面
三级主任科员使用的是公务员行政编制或者参公编制。而事业编副科实职，使用的是事业编。众所周知，编制类型的排序是：公务员编＞参公编制＞公益一类事业编＞公益二类事业编＞公益三类事业编。因此，三级主任科员的编制排名比事业编副科实职靠前。
二、从工资待遇上排序，三级主任科员排在事业编副科实职前面
以我们县直单位为例，三级主任科员，加上每月打卡工资、公积金、年终奖，全年总收入大概9.2万元；事业编副科实职，全年总收入大概8.5万元。可知，三级主任科员工资待遇高于事业编副科实职。
三、从政治待遇上排序，三级主任科员排在事业编副科实职后面
三级主任科员，在县直单位可能就是一般工作人员，可能不是单位党组成员，没有决策权、签字权，不能参与单位领导分工，可能享受不到副科实职的政治待遇和工作待遇。而事业编副科实职，在县直事业单位属于单位领导，甚至可能是单位一把手，在单位拥有至高无上的一把手权力，拥有工作安排权、人事调配权、重大事项决策权。这方面，事业编副科实职要排在三级主任科员前面。
四、从社会地位上排序，三级主任科员排在事业编副科实职后面
三级主任科员，由于在单位是一般工作人员，没有任何权力，掌握的资源不多，人脉资源较少，社会地位不是很高。而事业编副科实职，属于单位领导，掌握一定的社会资源，与其打交道的人员的层次相对较高，人脉资源相对较多，社会地位当然也就高一些。
五、从提拔晋升上排序，三级主任科员排在事业编副科实职前面
三级主任科员，在县直单位，即可转为副科实职，或者一步到位提拔正科级实职；或者可以晋升二级主任科员，享受正科级工资待遇。而事业编副科实职，由于受编制限制，发展前景不是很广阔，在县直单位已经触摸到天花板，想要转为公务员，由于程序比较复杂，操作起来也有难度。因此，事业编副科实职在县直单位，几乎没有晋升的希望，极有可能在副科级位置上原地踏步、终此一生。
公务员队伍里，实行职级并行，实职副科属于领导职务，三级主任科员是职级。从待遇方面说，三级主任科员的工资比实职副科多一些，就像一级主任科员比实职正科工资高一点。但是从权力分配来说，实职副科属于领导干部，有更多的权力。
体制内的领导排序有非常多的讲究，既要考虑职务，也要考虑单位，在同级别的情况下还要综合考虑个人提拔和任职时间等因素；既有综合排序，也有单项排序，用一两句话很难解释清楚。
以题主举例的三级主任科员和事业副科实职为例，不掺杂太多复杂因素，一般来说，三级主任科员的综合排序要在事业副科实职之前。
理由有两点：
第一，三级主任科员科员代表的是单位，即行政机关。同一个系统，行政机关一般都是事业单位的上级主管部门，政治地位高于事业单位，因此哪怕是上级机关一个科员到下级事业单位，或者同时代表单位去外面开会、调研，出于尊重等方面考虑，都要把科员的座次排在事业单位领导的前面，毕竟前者代表的是单位，是上级。
而如果不是一个系统，按照行政领导事业的基本原则，一般也会把三级主任科员放在事业单位副科实职之前，道理如上，因为前者代表的是行政机关，后者代表的是事业单位。比如开大会，会务人员按照单位排序，行政机关的桌卡都排在事业单位之前。
第二，三级主任科员一般都是由公务员副科实职晋升而来。如果是由公务员副科实职兼任，排序毋庸多言；如果不是，毕竟三级主任科员原来是副科实职，是领导，不管从经历，从职务，从尊重，还是从单位性质等等方面考虑，三级主任科员的座次按理都应排在事业副科实职之前。
这是基本的政治规矩。能够在基层单位走到副科岗位，都是讲政治、懂规矩的干部，都清楚尊重上级、给上级面子就是给自己机会。所谓宰相门前三品官，上级始终是上级，平台高晋升快。所以任何从上级机关来的干部都不能小觑，因为说不定哪天对方就成了自己的领导。有了这个可能，谁还敢轻易拿上级的干部不当回事？
综上，于情于理分析，三级主任科员排序都应在事业副科之前。
如果从个人来排名，首先要看的就是职务，那么事业编副科，实职排名在三级主任科员之前。但大多时候个人在外代表的是单位，三级主任科员代表的是行政机关，而事业副科代表的是事业单位，所以从这点看，三级主任科员排名在事业编副科实职之前。
根据公务员法和公务员职务与职级并行相关规定，我们知道，公务员有职务和职级两个序列。职级公务员有对应的职务级别，主要享受的是相应职务级别的工资待遇，不享受相应职务级别的政治待遇和工作待遇。职级公务员如果兼任领导职务，则按照领导职务进行管理，如果不兼任领导职务，则按普通公务员进行管理。
三级主任科员与公务员乡科级副职处于同一职务层次，别以事业编副科实职（管理岗八级）处于同一层次，所以在级别上，三级主任科员和事业编副科实职是一样的。但事业编副科实职是与公务员乡科级副职一样，是领导职务，享受副科级职务层次的政治待遇和工作待遇；而三级主任科员因为是职级，不享受副科职务层次的政治待遇和工作待遇。所以，从个人待遇上来讲，事业编副科实职排名要在三级主任科员之前。
但我们知道，个人在外如果有需要排名的情况，首先要看的还是你所在的单位，因为对外你代表的是单位，所以一般要按照单位的情况来进行排名。三级主任科员所在的单位肯定是行政机关或者是参公事业单位；而事业编副科实职所在的单位肯定是事业单位。一般来说，行政机关或者参公事业单位更加具有管理职能，一般是某些事业单位的主管部门或上级部门。所以，三级主任科员所在单位的排名一般都是在事业编实职副科所在单位之前。
另外，公务员三级主任科员的工资待遇也要高于事业编实职副科，而且编制更好，也更有发展前景。事业编副科实职的工资待遇一般与公务员乡科级副职的待遇差不多，甚至更低，而三级主任科员的工资待遇要高于乡科级副职。所以在待遇上，三级主任科员比事业编副科师资更高。三级主任科员是公务员，使用的是行政编制，而事业编实职副科显然是事业编制，行政编制更加稀少，编制更好。三级主任科员所在单位的级别一般是高于事业单位，又有职务与职级并行这样的规定，而且更加容易调到事业单位或国有企业工作。反之，事业编副科实职想要调任公务员却很难。
综上所述，如果从个人情况来看，事业编副科实职的排名在三级主任科员之前。但如果从个人所代表的单位来看，三级主任科员有排名在事业编副科实职之前，而且三级主任科员工资待遇更高，编制更好，更有发展前景。