我的理解是dna只能保证产生编码好的结构，而不能保证产生可预测的思维或者意识。尽管物质是产生思维的基础，但并不是充分必要条件。打个不恰当的比方，有钱是发展好足球的必要条件，但不是有钱就能产生一流球队。
大脑的很多意识活动和思考方式都是遗传物质DNA决定的，但基因并不能决定所有。
决定和影响大脑基本结构和功能的基因
决定大脑基本构造的基因赋予或限制了大脑的思考方式
人类的大脑是大猩猩的3倍，进化出了很多大猩猩没有的脑区，比如语言区。人类最显著的能力就是语言。我们绝大多数思考和记忆都是用语言进行的。比如买了6个鸡蛋，每个8毛钱，我应该付多少钱呢？我们调用了记忆里的乘法口诀，六八四十八。这里的思维和记忆都是语言形式的。动物没有语言，无法用语言去思考，只能借助其他方式。动物与人思考方式的不同是由DNA决定的。
致病基因
有些变异基因会改变大脑的结构，比如导致抑郁症、孤独症、21三体综合征等变异基因，会影响人的智商、思维。
决定本能心理的基因
一个明显的例子是人类的择偶策略。男人永远喜欢年轻漂亮、肤白貌美的女人，因为这样的女人更具生育价值。女人喜欢身体强壮、有钱有势的男人，因为这样的男人占据更多的资源。再比如性嫉妒心理，当我们看到妻子或女朋友跟别的男人谈笑风声有肢体接触的时候，嫉妒心油然而生，是不由自主的。还有我们对待亲生子女和外甥侄子的思考方式也是不同的。这些进化来的心理策略都是基因决定思考方式的例子。
进化来的心理策略可能比我们想象的要多的多。生理上，我们有庞大且专门化的器官组织(如肺、肝、心、肾、皮肤等)去应对庞大且细化的生存环境压力。心理上也很有可能是一样的，我们会进化出很多心理反应去专门应对进化中频繁出现的场景。而这些进化出来的心理都是细微精巧的脑回路决定的，也是DNA决定的。
一般性机制的基因赋予大脑自由
如果我们所有的思考方式都是进化而来的，我们就无法面对新的问题。但如今很多问题都是进化中从来没见过的，我们依旧可以处理的游刃有余，甚至创造性的解决。这说明有一般性的能力或者脑结构，允许我们处理新的问题，生成新的思路。比如，可塑性、智力、工作记忆、类比推理等等。有了工作记忆这个容器，我们可以放数字、字母、公式等任何放得下的东西，只要我们愿意。有了智力和推理能力，我们可以推导数学公式、也可以编写代码、解决物理问题等，这些学科需要不同思维方式。
DNA给了我们一般化的能力，我们可以用来思考多种多样的事情。DNA是无法限制我们用一般化能力来思考什么问题、进行什么意识活动的。
为何无意识的DNA能产生有意识的大脑?
意识是什么？意识是怎么产生的？这些是心理学脑科学的终极问题，可能现在没人有正确答案。但在道理上不难解释。比如，一堆沙子没有任何用处，但经过加工变成有组织结构的芯片后就拥有了强大的计算能力。大脑也类似，无意识的东西只要以某种特别的方式组合在一起，协同合作，就可以产生新的东西，就可能产生意识。
总结
基因决定了大脑结构，决定了人类思考问题的基本方式（比如用语言思考），并且基因进化出了许多心理机制，会让我们程序化的产生某些想法（比如择偶、性嫉妒）。所以基因可以决定我们很多思维方式，甚至决定了绝大多数。但基因也让大脑有了一般性的机制，大脑可以在一般性的机制基础上去做各种各样的思维、推理和创造。
先说结论，基因形式决定思考方式。比如鸟类和哺乳类都是动物，因为各自的基因不同，必然有不同的思考方式。
举例说明最简单。所有人都见过一个现象，一只流浪狗在漫步觅食，当你慢慢走到它身边，它会有所警惕你，会望着你，只要你没有恶意，它会继续低头觅食不再关注你。一只小鸟落在地上觅食，当你慢慢走向它，哪怕很小心很轻很慢，只要它发现你立刻就会飞走，不会去判断你有无恶意。
这说明，狗已经具有了比较高级的思维，已经可以通过观察，对周边环境进行复杂判断；鸟的思维做不到这一点，于是所有靠近它的大型动物都是一种威胁。
我个人还有一个经历，也经常用做例子说明问题。骑电动车在路上走，一条流浪狗慢悠悠横过马路，抬头看了我一眼，突然加速蹿过马路，又慢悠悠走着。狗看了一眼，立刻就比较出自己的速度和电动车的速度，做出“有威胁”的判断，采取了加速通过的行为决定。
对于这一点来说，每个人都能做出，但如果要更精确比较出速度差，必须用数学计算。很明显，狗不会计算，是进化把这种复杂计算压缩成某种集约化形式，写进了狗的基因里。同样，人有一切低等动物为了保护生存而形成的基因形式，所以人既可以看到大型猛兽不用思考就立刻逃跑的行为，又有看到大型食草动物判断出安全状态的彼此相安无事，还有测量距离与时间后更精确的速度计算。
显然，基因形式决定了不同动物的思考方式和最终形成的意识。
路过顺手答。
首先要考虑一类特殊情况：致病基因。早在2010年就有研究表明，MKP-1基因与抑郁症有明显的相关性。类似的基因还有很多，虽然不能说“XX基因导致XX病”，但认为它们会影响意识活动是合理的。
其次，如果是非致病基因，是否会如题主所言呢？
《自私的基因》用了一个比喻来说明问题：基因是策略制订者，个体则是执行机构。执行结果怎么样，并不是基因能直接控制的范畴。基因只能尽可能地优化策略，提升大脑根据生存环境自我完善的能力。
更直白也更笼统地说：基因是老师，大脑是学生。当然，基因本身没有意识，它们的“策略”是自然选择的结果。
题主说的“无意识基因产生有意识大脑”，是物种进化的一次大突破。进化早期，生物没有大脑只有神经系统，那时才是基因决定一切行为的田园时代。
后来大脑出现了，动物可以更精准地控制身体，从而获得生存优势。在意识出现之前，部分动物已经获得后天学习的能力，把没脑子的前辈甩了九条街。
然而没有意识，这些“聪明”的动物仍然摆脱不了生存机器的身份。它们仅仅是基因繁衍的手段。
当然，复杂大脑的生存优势十分明显。于是“复杂派”基因比重稳步提升，大突破发生了。当生物意识到“自我”的存在，基因对行为的直接控制程度便大幅削弱。
打个比方：
你饿了会点外卖，不会炖了家里的狗，除非它是哈士奇。
同事在领导面前抹黑你，你会用业绩还自己清白，不会跟那家伙决斗。
你吃完饭会看一会书，读读报纸，甚至仰望星空，而不是心急火燎地繁衍后代。
碰到敌人你仍然会进入战斗/逃跑模式，但同时还会报警，甚至发自拍附文“宝宝好害怕”。
……
这也是人类最值得自豪的地方。我们仍然是生存机器，但不再仅仅是生存机器。无论我们的大脑天资如何，都有靠后天努力改善自己的潜能。
容我中二一下：总有一天，人类能摆脱基因的控制，成为纯粹的意识存在。